香水的颜色大都是琥珀色或褐色，看起来很像宝石，其实这是天然香料的颜色。从来莉、玫瑰或水仙等天然鲜花中所萃取的精油都呈黄色、褐白或绿褐色。此外，香水中所添加的魅惑香气动物性香料也是褐色，苔类中的橡树苔是绿色，从树根或树根脂类中萃取的香料还是褐色。
香水是混合了许许多多的香料，再以酒精溶化而成，以天然香料调制的高级香水，都已经有它本来的颜色，香水的颜色经过一段时间酒精蒸发之后会变得更浓。合有很多浓茉莉精油的“喜悦”(Jean Petou)等香水，即使放到密封瓶里也会变成红褐色。
这是因为茉莉花香中所含的因多而，经过日光照射“所产生的变化。
因为香料的颜色，若不小心把香水沾到衣服上就会产生斑点。也许你会认为“将香料脱色之后再使用，不就没有这个问题了吗?”但是把香料脱色，美好的香味也就跟着不见了。
相反的，倒是可以把香水着色。香水若使衣服产生斑点就很麻烦，所以不可能把颜色弄的很浓，事实上有些香水是有着色的。
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